Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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SNAPC1Q16533 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SNAPC1Q16533 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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