Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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E2F4Q16254 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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E2F4Q16254 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
E2F4Q16254 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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E2F4Q16254 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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E2F4Q16254 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
E2F4Q16254 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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