Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNCBQ16143 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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