Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZIC1Q15915 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms