Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
SIX1Q15475 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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