Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PDK3Q15120 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PDK3Q15120 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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