Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
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