Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
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