Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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SHROOM2Q13796 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SHROOM2Q13796 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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