Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PEX6Q13608 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms