Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PKD2Q13563 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms