Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SNTA1Q13424 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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