Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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