Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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