Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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ERCC8Q13216 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
ERCC8Q13216 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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