Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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NR1H3Q13133 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NR1H3Q13133 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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