Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
GPS1Q13098 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms