Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
TRAF1Q13077 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
TRAF1Q13077 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms