Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PRDM2Q13029 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PRDM2Q13029 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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PRDM2Q13029 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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PRDM2Q13029 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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PRDM2Q13029 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PRDM2Q13029 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
PRDM2Q13029 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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