Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK2Q13002 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms