Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMARCB1Q12824 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMARCB1Q12824 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMARCB1Q12824 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMARCB1Q12824 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMARCB1Q12824 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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