Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
FOXO1Q12778 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms