Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CENPEQ02224 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CENPEQ02224 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms