Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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