Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CASQ1P31415 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CASQ1P31415 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CASQ1P31415 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms