Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CTIFO43310 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CTIFO43310 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms