Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TIMMDC1Q9NPL8 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms