Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SPOCK3Q9BQ16 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.8 ms