Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC47Q96A33 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC47Q96A33 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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