Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-CQ95604 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms