Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CHCHD4Q8N4Q1 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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