Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.46□□□□□ -2.17
CFAP47Q6ZTR5 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CFAP47Q6ZTR5 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms