Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRM9

Putative uncharacterized protein FLJ46235, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZRM9 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Q6ZRM9 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms