Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC93Q567U6 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC93Q567U6 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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