Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PDK4Q16654 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PDK4Q16654 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PDK4Q16654 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDK4Q16654 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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