Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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NPTX1Q15818 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NPTX1Q15818 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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NPTX1Q15818 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NPTX1Q15818 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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