Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ITGA9Q13797 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ITGA9Q13797 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms