Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
APOFQ13790 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
APOFQ13790 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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APOFQ13790 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
APOFQ13790 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
APOFQ13790 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
APOFQ13790 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
APOFQ13790 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
APOFQ13790 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
APOFQ13790 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
APOFQ13790 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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