Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
ATP1A4Q13733 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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