Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
NEUROD1Q13562 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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