Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
HDAC1Q13547 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
HDAC1Q13547 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms