Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TCIRG1Q13488 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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