Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
MSLNQ13421 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
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