Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCGB2A2Q13296 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms