Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CLN3Q13286 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CLN3Q13286 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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