Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SRSF6Q13247 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SRSF6Q13247 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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