Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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