Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IFT88Q13099 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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IFT88Q13099 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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