Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TRDNQ13061 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TRDNQ13061 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms