Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NFX1Q12986 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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